Programet e studimit të ciklit të dytë synojnë të japin njohuri bazë mbi metoda shkencore të përgjithshme dhe aftësi të caktuara në lidhje me shkencat sportive.
Programet e studimit në Universitetin e Sporteve të Tiranës kanë 120 kredite (ECTS) dhe kohëzgjatja e tyre është 2 (dy) vite akademike.
Fakulteti i Shkencave të Lëvizjes
- Master i Shkencave në Mësuesi në Edukimin Fizik e Shëndetësor

- Program i përbashkët me Universitetin Carlo Bo, Urbino Itali Master i Shkencave në Shkenca Sportive
Fakulteti i Vepritarisë Fizike dhe Rekreacionit
Fakulteti i Shkencave të Rehabilitimit
- Master i Shkencave në Fizioterapi Klinike dhe Rehabilitim

- Master i Shkencave në “Shkenca Rehabilituese të Profesioneve të Shëndetit”, i organizuar dhe ofruar në kuadër të një programi të përbashkët ndëruniversitar (Joint Degree) nga Fakulteti i Shkencave të Rehabilitimit të Universitetit të Sporteve të Tiranës, në bashkëpunim me Universitetin “Magna Graecia” të Katanzaros, Itali

